El SEDES Chuquisaca a la cabeza de la Dirección Técnica tiene como unidades funcionales:

• Unidad de Auditoría Interna
• Unidad de Planificación
• Unidad de Asesoría Jurídica
• Unidad de Recursos Humanos
• Unidad Administrativa y Financiera
• Unidad de Información para la Salud
• Unidad de Servicios y Gestión de la Calidad
• Unidad de Epidemiologia
• Unidad de Seguros Públicos de Salud
• Unidad de Promoción de la Salud